生物信息学:一个简介虚拟实验室

踏上任务以鉴定在稀有植物中产生抗疟过程的代谢途径。你能开始创造一种新的抗疟药吗?

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关于生物信息学:一个简介虚拟实验室

该模拟替换了以前的“工厂转录组织”模拟。

如果您可以将代谢途径从稀有植物从稀有植物中的代谢途径转化为另一个生物,并在大规模生产抗疟过程中?在此模拟中,您将学习如何识别编码特定酶的基因。您将使用称为RNA-SEQ的方法量化不同基因的转录。使用这些信息使用生物信息学工具缩小候选基因。

找到一种新的抗疟型化合物

您的使命开始于从亚马逊雨林的分析植物样本。一群局部部族人用这种稀有植物治愈疟疾。植物化学家识别抗疟性化合物。您的任务是识别负责该潜在药物的生产的酶。

了解如何产生分子化合物并提取RNA

您的下一个任务将是鉴定将前体分子转化为抗疟组件的酶促途径。如果要大量生产这种化合物,则需要将酶促途径转化为另一个生物。为此,您必须识别编码酶的基因。您需要的所有信息包含在不同植物组织中mRNA分子的组合物中。

了解mRNA和DNA的结构差异,进行RNA-SEQ

mRNA和DNA功能的关键是它们的结构。虽然实验室助手是逆转录到cDNA的mRNA样本,但您将学习这两个惊人分子的结构。然后,您的下一个任务是执行CDNA样本的下一代测序(NGS)。您将序列不同植物组织的cDNA以确定靶酶的序列和表达。动画将向您展示流程单元内发生的内容,使您能够查看如何并行读取数百万不同的序列。

使用系统发育分析和爆炸分析结果

与真正的侦探一样,您将分析大量的NGS读数并确定哪种酶最有可能参与抗疟性化合物的生物合成。您将了解DNA序列的相关性可用于识别未知酶,并学习序列比较的基础知识。

您是否能够识别酶并产生一种可以节省数百万人的新型药物?

现在就开始

踏上任务以鉴定在稀有植物中产生抗疟过程的代谢途径。你能开始创造一种新的抗疟药吗?

实验室中的技术
爆炸,RNA-SEQ
学习目标

在这个模拟结束时,你将能够......

  • 了解基因如何参与化合物的合成
  • 了解下一代测序技术如何用于测量基因表达
  • 使用爆炸和系统发育分析筛选候选基因
模拟功能

长度:25分钟
可访问性模式:不可用
语言:英语(美国),西班牙语,德语,意大利语,法语

NGSS.

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IB.

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AP.

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