当多次重复一系列碱基时，产生串联重复。序列Atgatgatgatgatgatgatgatgatg具有重复的序列“ATG”八次。重复的序列被称为基序。每重复10-60个碱基的重复称为小型卫星，其中较短的重复（2-9个碱基）称为微卫星（或strs =短串联重复）。串联重复区域存在于人类基因组中的许多位点，并且在它们的重复数量不同。
串联反复区域将在个人之间具有不同数量的重复。重复可以是二核苷酸，三核苷酸等。放置在可变序列的侧翼区域上的一组引物将根据重复的数量扩增不同长度的片段
由于复制错误，串联重复区域发生变化
由于基因组DNA的复制中的误差，人体中串联重复次数的差异。DNA聚合酶沿DNA滑动并添加互补核苷酸。当超过高度重复的序列（例如微卫星）时，DNA聚合酶有时是“打嗝”，导致跳过整个重复或产生额外的重复。添加或移除单一重复图案的过程也称为逐步突变过程。高重复序列的DNA聚合酶复制误差是相当常见的。这意味着具有大量重复的微卫星的突变率非常高。
串联重复地区作为分子标记
微卫星没有任何蛋白质的代码，因此被认为是中性标记。高突变率和大量可能的位点使微卫星变得令人难以易用作为群体遗传学，父母分配研究和法医学的分子标记。