优点:

• 避免移植排斥反应。由于诱导多能干细胞是从患者自身的细胞培养而来的，因此应该有可能避免经常导致对移植细胞排斥的免疫反应。

• 避免道德问题。iPS并非来源于人类胚胎，因此避免了胚胎干细胞使用所带来的伦理问题。

• 简化了患者特异性干细胞的生成，这种干细胞可用于在培养皿中模拟疾病。这些模型在定义疾病病理机制方面有价值，从而在药物发现和治疗靶点的确定中发挥重要作用。

缺点:

• 这四种转录因子的残留表达可能诱发肿瘤。原癌基因是一种众所周知的致癌基因。