我们需要准备两种类型的DNA。DNA样品是要测试的DNA，DNA参考作为比较。可以使用从羊水或脉络膜绒毛样品中获得的细胞中提取的DNA进行产前阵列CGH。使用带有硅胶膜的色谱柱进行典型的DNA提取，DNA将特异性结合。所有污染物都将通过硅胶膜并被冲走。

请注意，产前样品有被母细胞污染的风险。分析阵列CGH结果时，母体细胞的存在可以掩盖潜在的胎儿染色体异常。母体细胞污染（MCC）构成假阳性或假阴性产前误诊的风险。