Il sistema di espressione diE. coliè uno dei più diffusi e studiati. Si tratta di un eccellente sistema per l'espressione di proteine funzionali non glicosilate; al contrario, la produzione di proteine glicosilate richiede un apparato di Golgi, che le cellule diE. colinon possiedono. I batteri non hanno sviluppato un meccanismo sofisticato per eseguire modificazioni post-traduzionali. La seguente tabella riepiloga i vantaggi e gli svantaggi diE. colicome sistema di espressione.
| Vantaggi | Svantaggi |
|---|---|
| Espressione rapida | Le proteine con legami disolfuro sono difficili da esprimere |
| Resa elevata | Produce proteine non glicosilate |
| Facilità di coltura e di modifica del genoma | Proteine prodotte con endotossine |
| Sistema economico | Formazione di acetato, con conseguente tossicità a livello cellulare |
| La produzione di massa è rapida e conveniente | Proteine prodotte come corpi di inclusione inattivi che richiedono il ripiegamento |

Figura 1.Sistema di espressione batterica.