像所有细胞一样，细菌从环境中吸收营养并将其转化为能量和细胞成分。酶，具有催化活性的蛋白质，是进行许多必需的代谢反应所必需的。代谢过程和酶学特性因菌株和菌种而异。这种差异可通过差别或选择性培养基和生化试验加以利用。