Ogni microrganismo ha una caratteristica distinta quando viene coltivato su determinati terreni agar sulla piastra di Petri. Questa cosiddetta morfologia generale include la forma della colonia, le dimensioni, il colore e le caratteristiche della superficie.

Esempi di forme di colonie di microorganismi comuni:
Morfologia delle colonie diSaccharomyces cerevisiaesu agar Sabouraud dextrose: color crema e liscio.
Lactobacillus: forma circolare e margine intero.
L'identificazione della morfologia delle colonie è il metodo più semplice diidentificazione microbi. Per un'identificazione più specifica può essere analizzata al microscopio lamorfologia della cellula.