Coomassie-Brillantblau ist ein Farbstoff, der in der analytischen Biochemie verwendet wird, um Proteine einzufärben.
Durch die Bindung an ein Protein wird der negativ geladene Zustand des Farbstoffes stabilisiert. In dieser anionischen Form ist der Farbstoffblau. In der ungebundenen bzw. kationischen Form ist der Farbstoffgrün/rot(abhängig von der Art des Farbstoffs).