DAPI是一个荧光染料它与DNA中富含a - t的区域紧密结合。当它与DNA螺旋的小凹槽结合时，就会变得高度荧光。DAPI的最大吸收波长为358 nm(紫外)，最大发射波长为461 nm(蓝色)。因此，可以在荧光显微镜下观察DNA，用紫外光照射DAPI染色样品，过滤蓝光。