多样性指数是用来评估一个区域内物种数量和分布的定量指标。指数有许多不同的类型。有些指数非常简单，只考虑了该地区存在的物种数量(丰富度)，而另一些指数也考虑了群落的均匀性(Shannon和Simpson指数)。

Shannon指数(H′，见图1)考虑了整个群落中物种的数量和均匀度。

Shannon指数是用一个物种的个体与所有物种的总个体数的比例(pi)，乘以该数字的自然对数来计算的。这是对每个物种做的，然后把所有的数字加起来。自然系统中的香农指数通常在0.5到5之间变化。一般情况下，Shannon指数小于2的区域被认为是低多样性区，而Shannon指数大于3的区域被认为是高多样性区。

虽然多样性指数对评价一个地区的多样性非常有用，但也可能隐藏了一些信息。的重要性特有的物种在这样的指数中特别容易被稀释。地方性物种是指地理分布非常有限的物种，所以它们只能在某一地区发现，而在世界其他任何地方都找不到。在该指数中，一个特有物种只是该地区的多一个物种，但实际上不止于此，因为如果将其从该地区移除，就意味着该物种的灭绝。因此，在需要作出决定时，必须考虑到流行的情况。