La clave para unafermentacióneficaz es controlar y mantener el crecimiento microbiano y la producción de metabolitos dentro delfermentador o biorreactor. Para lograr un crecimiento microbiano y una producción de metabolitos sostenibles, hay que controlar ciertos parámetros:

• Esterilización de medios y recipientes
• Suficiente sustrato y factores de crecimiento (por ejemplo, vitaminas) en los medios
• Agitación (mezcla)
• Control de temperatura
• Control de pH
• Antiespumante (durante la fermentación se forma espuma, que puede interrumpir el equipo de medición)
• Control de desbordamiento (se usa cuando se añaden medios continuamente)
• Aireación (suministro de oxígeno para procesos aeróbicos)

Es muy importante realizar la fermentación mediante unatécnica estéril. Los contaminantes compiten con el organismo de producción por los nutrientes y llevan a la disminución de la producción de producto.