La maggior parte dei problemi di salute di un pesce è imputabile alla qualità dell'acqua. Si può eseguire unanecroscopia del pesceper determinarne la causa della morte, che può essere chimica, biologica, fisica o una qualunque combinazione di queste.

Si tratta di categorie ampie che includono cause relative a:

• Cause del decesso legate all'ossigeno (anossia, ipossia, mancanza di ossigeno nell'acqua in inverno, fioriture algali)

I livelli di ossigeno nell'acqua possono scendere sotto la soglia necessaria per la vita. Con bassi livelli di ossigeno, i pesci fisostomi provano a sopravvivere risalendo in superficie per respirare aria. La dimensione del pesce in questione è un parametro rilevante: una moria di pesci causata da bassi livelli di ossigeno non includerà pesci di piccola taglia, a meno che non si siano raggiunte concentrazioni criticamente basse.

• 导致del decesso使节traumi (pescatori predatori, esplosioni, effetto turbina)

I traumi legati a esplosioni possono avere conseguenze negative non solo sui pesci, ma anche sull'intero ecosistema. Gli habitat circostanti, come le barriere coralline, vengono infatti spesso danneggiati dalle esplosioni.

• Tossine o cattiva qualità dell'acqua (inquinamento industriale o domestico, pesticidi, fertilizzanti, petrolio, sbalzi termici, variazioni nella salinità, alghe tossiche)

• Malattie o pressione demografica (malattie virali, batteriche, fungine, parassitarie, stress riproduttivo, sovrappopolazione)