Cuando una sustancia absorbe la luz, el electrón se excita y pasa a un estado superior. Cuando el electrón salta de vuelta al estado electrónico inferior, emite energía en forma de ondas electromagnéticas. Las sustancias fluorescentes emiten ondas electromagnéticas dentro del espectro de luz visible, es decir, entre 390 y 700 nanómetros.
Los fluorocromos se usan en muchas técnicas, como lamicroscopía de fluorescencia, laqPCR, lacitometría de flujoy laCFF.
Hay diferentes modos de etiquetar fluorescentemente las moléculas, entre los que se incluyen: