Quand la lumière est absorbée par une substance, elle provoque l'excitation d'un électron qui passe à un état supérieur. Lorsque l'électron revient à l'état électronique inférieur, il émet de l'énergie sous forme d'ondes électromagnétiques. Les substances fluorescentes émettent des ondes électromagnétiques dans le spectre de la lumière visible, c'est-à-dire entre 390 et 700 nanomètres.
Les fluorophores sont utilisés dans de nombreuses techniques telles que lamicroscopie一发出荧光nce, laqPCR, lacytométrie en fluxet leFACS.
Il existe différentes façons de marquer une molécule de manière fluorescente, notamment :