Gliesperimenti di ibridazione di Mendeldimostrano la differenza tra fenotipo e genotipo. Quando piante di linee pure (P1), in cui un genitore ha baccello giallo e l'altro baccello verde, vengono sottoposte a impollinazione incrociata, tutta la prima generazione filiale (F1) ibrida presenta baccelli gialli. Ciò significa che i discendenti ibridi presentano fenotipo identico al genitore di linea pura con i baccelli gialli. Tuttavia, sappiamo che l'allele donato dal genitore con i baccelli verdi non va perduto, perché riappare in alcuni esemplari della seconda generazione filiale (F2). Si può quindi dire che le piante F1 hanno un genotipo diverso dai genitori con i baccelli gialli.

Le piante P1 usate negli esperimenti di孟德尔sonoomozigoteper il tratto di interesse nello studio. Gli organismi diploidi che sono omozigoti per un dato gene, o locus, hannodue alleli identiciper quel gene sui loro cromosomi omologhi. Le piante usate da Mendel come generazioni parentali presentano aspetto costante anche dopo numerose generazioni, perché entrambi i gameti portano lo stesso tratto. Quando le piante P1 vengono sottoposte a impollinazione incrociata, però, tutti gli esemplari della generazione filiale sonoeterozigotiper il tratto contrastante, che significa che il loro genotipo riflette il fatto che hannoalleli diversi per il gene in esame.