Mikroorganismen können überall gefunden werden und Begegnungen zwischen Menschen und Mikroben sind häufig. Zusätzlich sind Teile des menschlichen Körpers mit Bakterien besiedelt. Diese Bakterien können harmlos und sogar vorteilhaft sein (Symbionten), oder Krankheiten verursachen (Pathogene). Pathogene können entwederdirektoderindirektübertragen werden (durch kontaminiertes Essen oder Trinken oder durch Berührung kontaminierter Oberflächen). Menschen besitzen unterschiedliche Abwehrmechanismen gegen Mikroorganismen. Haut oder muköse Membranen dienen als physikalische Barriere, Speichel und Mukus können Mikroben abtransportieren, saurer pH oder Gallensalze können die Mikroorganismen schädigen. Symbiontische Bakterien (auch normale Flora, Mikrobiota oder dasMikrobiom) können als Schutz vor Pathogenen dienen, indem sie das Wachstum anderer Mikroben behindern und ihren kompetitiven Vorteil in ihrer Nische ausnutzen. Das Immunsystem des Wirts kann eine spezifische Immunantwort auslösen, um eine Invasion von Mikroben zu verhindern. Wenn ein Pathogen durch die Abwehr des Wirts bricht, kann es eineInfektionskrankheitverursachen.