La chromatographie par échange d'ions est un type dechromatographie liquidedans lequel les molécules de l'échantillon sont séparées en fonction de leur charge.

Elle est utilisée couramment pour séparer les molécules biologiques chargées telles que les protéines, les peptides, les acides aminés ou les nucléotides. Par exemple, les acides aminés des protéines contiennent des groupes chimiques chargés positivement et négativement. Les protéines peuvent porter une charge nette positive ou négative, voire aucune charge, en fonction du pH de leur environnement.

Le pH où la protéine n'a pas de charge est appelé point isoélectrique. Par conséquent, le choix du pH du tampon détermine la charge nette de la protéine en question. Si le pH du tampon est supérieur au point isoélectrique de la protéine en question, celle-ci portera une charge négative nette. En revanche, s'il est inférieur, la protéine portera une charge positive nette.

Laphase stationnairedoit être sélectionnée selon la charge nette des molécules à séparer. De plus, comme les échantillons sont des mélanges de différents composés qui ont des charges différentes, un gradient de tampon est normalement utilisé pour éluer chaque composé différent séparément (figure 1).

Figure 1 : exemple de chromatographie par échange d'ions.