代謝経路は,基質分子が最終生成物に変換される相互接続一連の生化学反応で成り立っています。これらの変化は段階ごとに発生し,色々な代謝中間分子が生成されます。反応の各段階は酵素というたんぱく質によって促進されます(触媒作用)。
ここで重要なのは,代謝経路は単独で行われているのではないということです。ある経路の基質,中間物,最終生成物は他の経路でも反応する可能性があります。例えば,炭水化物,たんぱく質,脂質の異化分解は細胞呼吸に収束します。