分子克隆是指DNA分子的组装成一个向量随后改变生物（通常是细菌或酵母）。分子克隆方法是生物学和药物的核心。术语分子克隆包括许多不同的Techinques。典型的分子克隆流程如下所示：
感兴趣的基因的分离
将基因克入载体
用载体构建转化宿主生物
转化细胞的抗生素选择
用相同的遗传背景分离克隆
通过进行DNA测序可以确定质粒组件的确认。重要的是要确认插入物已成功地连接到具有正确构象和读取框架的质粒载体中。框架转变会导致非功能统计学蛋白表达的废话或沉默突变。