核酸杂交是一种分析生物样品的DNA或RNA的技术。它可用于测量表达水平或基因分型。核酸杂交基于两个的特异性结合（退火）补充单链核酸（DNA或RNA）分子。在DNA中，碱腺嘌呤始终形成与胸腺嘧啶的键，而鸟嘌呤始终形成与胞嘧啶的键。在RNA中，胸腺氨酸取代，与腺嘌呤形成碱基对。

为了进行核酸杂交分析，首先从样品中纯化DNA或RNA。稳定的双链核酸序列是变性的，并碎片形成短单链，可以用已知的序列与单链寡核苷酸结合，称为探针。通过荧光，放射性或化学发光报告基标签检测到未结合的DNA或RNA，并将靶DNA或RNA与探针的结合与探针结合。如有必要，可以在分析之前通过PCR扩增样品DNA（扩增的DNA杂交测定法）。

图1：核酸杂交：将单链靶DNA或RNA添加到寡核苷酸探针中（步骤1）。靶DNA或RNA与互补探针结合（步骤2）。洗净未结合的靶DNA或RNA并检测到互补结合（步骤3）。