La pureza del ácido nucleico puede determinarse midiendo la absorbancia a diferentes longitudes de onda.

Los ácidos nucleicos absorben la luz a260nm, mientras que las proteínas la absorben a 280 nm y los contaminantes químicos (como los compuestos orgánicos fenol y trizol) absorben la luz a 230 nm. Además, también se puede medir la absorbancia a 320 nm para detectar la presencia de contaminación por partículas.

Por lo tanto, la pureza del ácido nucleico se puede evaluar fácilmente calculando la relación de260/280 nm,260/230 nm, y260/320 nm.

Cada relación tiene un valor específico que determina la pureza de la muestra:

• Para 260/280, una relación de aproximadamente 1,8 se considera ADN puro. En el caso del ARN, la relación debería ser más alta, alrededor de 2.
• Para 260/230, una relación superior a 1,8 se considera una muestra pura de ácido nucleico.
• Para 260/320, una relación de 1,8-2,2 se suele considerar una muestra pura de ácido nucleico.