蛋白质被细胞内的各种酶水解成其组成成分氨基酸。大多数时候，氨基酸在合成新蛋白质的过程中被循环利用。如果氨基酸过多，或者身体处于饥饿状态，一些氨基酸会被分流到葡萄糖分解代谢的途径。每个氨基酸在进入这些途径之前必须去掉它的氨基基团。氨基转化成氨。在哺乳动物中，肝脏由两个氨分子和一个二氧化碳分子合成尿素。因此，尿素是哺乳动物的主要废物，由氨基酸中的氮原子产生，并通过尿液排出体外。尿素合成中使用的一些氨基酸的碳主链可以通过转化为乙酰辅酶a而成为能量的来源克雷布斯循环．