Die Tatsache, dassSubstratemit Markern oder Sonden „markiert“ werden können, macht es zu einem wichtigen Instrument für die Quantifizierung und Qualifizierung von enzymatischen Reaktionen. Diese Sonden können in radioaktive und nicht-radioaktive eingeteilt werden. Je mehr Marker vom Substrat abgespalten werden, desto mehr Zielenzym/enzymkonjugiertes Zielmolekül ist in der Regel vorhanden und desto höher ist das erfasste Signal. In manchen Fällen deutet jedoch ein geringeres Signal auf eine größere Menge des Zielmoleküls hin, was bedeutet, dass das beobachtete Zielmolekül nicht mit einem Enzym konjugiert ist bzw. kein Enzym ist.
Radioaktive标记信德sehr empfindlich, aber eine sehr kurze Halbwertszeit und damit eine begrenzte Nachweisdauer. Sie können durch PET-Scans und SPECT-Scans aufgrund der von den Radioisotopen abgegebenen Strahlung nachgewiesen werden. Einige Beispiele für Radioisotope sind:32P,33P,35S.
Diese Gruppe von Sonden lässt sich in 3 weitere Kategorien unterteilen:
Chemilumineszent Die Energie aus der enzymatischen Reaktion wird als Licht freigesetzt, ohne dass dabei Wärme entsteht.
Chromogen Bei der enzymatischen Reaktion entsteht ein farbiges Produkt.
Fluoreszierend Das Fluorophor wird vom Substrat abgespalten und das Emissionslicht kann bei der richtigen Anregungswellenlänge nachgewiesen werden.