PCR反应的效率对于正确的PCR解释是非常重要的qPCR结果．它取决于分析方法、主混合剂性能和样品质量。它是根据标准曲线计算的。

标准曲线是由几个qPCR反应，在10倍稀释系列DNA。稀释系列可以从你要测试的cDNA样本库中进行，依次稀释10倍。要绘制标准曲线，需要将每一种稀释度(下图上半部分)获得的ct值与用于绘制标准曲线的稀释因子(DF)的对数作图。标准曲线是通过这些点的回归线(下图的下方，左侧)。回归线斜率与放大效率的关系如下图所示。一般来说，80 - 110%的效率是可以接受的。在100%的情况下，PCR反应的每个周期的生成量会翻倍。您也可以使用回归线来确定未知样本的浓度从他们的ct值。