Durante el experimento dePCR cuantitativa、el、objetivo se copia repetidamente前者igual enen unareacción PCRnormal. El verde SYBR de la mezcla se une a las moléculas bicatenarias de ADN, lo cual hace que se vuelva fluorescente. Al final de cada paso de extensión, se toma una fotografía y se cuantifica la fuerza de la fluorescencia.

A diferencia de lo que pasa en la PCR normal, estas medidas permiten conocer la cantidad de fragmentos de ADN en tiempo real.
Tras el último ciclo, el termociclador de PCR cuantitativa mide la fluorescencia al mismo tiempo que hace aumentar la temperatura de manera estable para grabar lacurva de fusión.
La medida obtenida se envía a un ordenador para suanálisis.