细菌的细胞质中含有多种成分，细胞质被细菌所包围等离子体膜．

细菌的DNA自由地位于细胞质中被称为类核．细菌的DNA通常是圆形的，与真核生物的DNA相比，含有很少的非编码区。DNA的含量类核不同的菌株可以适应细菌生存的环境。例如，它可以编码在极端条件下生存所必需的蛋白质。

DNA在细胞质中自由转录，并被翻译成蛋白质70年代核糖体．活细胞生存最关键的必要条件之一是蛋白质合成。70S细菌核糖体由一个较小的30S亚基和一个较大的50S亚基组成。

有些细菌还含有质粒它们是细胞外的环状DNA分子。质粒通常含有能使细菌在其生存环境中具有生存优势的遗传物质。这可能是抗生素抗性基因，也可能是帮助细菌在硫湖或极端寒冷的极端环境中生存的基因。

细菌可以在缺乏营养的环境中生存。为了适应外部营养水平的波动，细菌可以将营养物质储存在其中包涵体在细胞质中。这些成分变化很大，可能含有碳水化合物、脂类、蛋白质或无机化合物。