Il gene ccdB codifica una proteina tossica che inibisce la proliferazione della cellula. I batteri che non codificano un gene ccdA (inibitore della proteina ccdB) periscono subito dopo l'assorbimento di un plasmide contenente un gene ccdB. Questa selezione positiva è uno strumento utile per laclonazione molecolare.

I geni ccdB sono utilizzati nellatecnica di clonazione Gatewaye nell'assemblaggio 3-A. Il gene ccdB viene solitamente usato nella spina dorsale del vettore che trasmette laresistenza agli antibioticialle cellule trasformate se il gene ccdB venisse sostituito dalla costrutto clonato.