共聚焦显微镜，或扫描激光共聚焦显微镜，是一种光学成像技术，增加分辨率和对比度的图像。在这种技术中,激光是用来照亮样品，因为强烈和单色光源是必需的。

共聚焦显微镜只照亮样品的一个点，而显微镜只照亮样品的一个点针孔用来消除失焦的光线。相比之下，广角显微镜均匀地照亮整个样本，从而获得一个大的、未聚焦的背景。

共聚焦显微镜的照明是通过扫描聚焦光束穿过样品，创造水平光学切片来实现的。这些光学切片可以在样品的不同深度收集，以重建3D结构，这一过程被称为Z-stacking．这种方法直接但无创，允许对厚的，有时是活的样本进行成像。

虽然使用共聚焦显微镜提高了光学分辨率，但在针孔处阻断荧光会导致信号强度降低。这就是为什么激光和光电倍增器管(PMT)使用。PMT将探测到的光转换成电能，供计算机用于成像。

尽管共聚焦显微镜不是一项廉价的技术，它的优点使其广泛应用于生物科学，从细胞生物学和遗传学到微生物学。

对于适合荧光显微镜的样品，它必须是荧光的。这意味着它必须包含荧光团．