Cy3和Cy5荧光染料结合DNA。它们对光敏感，应尽量在黑暗中储存和使用。因此，标记步骤是使用暗管来防止信号丢失染料光漂白。

Cy3和Cy5分子与DNA通过通用连锁系统(ULS)相互作用，ULS使用一种特殊的铂化合物。铂化合物有两个自由结合位点。第一个结合位点与标记基团结合，标记基团是Cy3和Cy5，形成Cy ULS复合体。第二个结合位点将复合物与单链、双链、线性或超螺旋DNA或RNA的嘌呤连接。

Cy3和Cy5分子通过通用连锁系统(ULS)与DNA相互作用，该系统使用一种特殊的铂化合物。铂化合物有两个自由结合位点。第一个结合位点与标记基团结合，该标记基团是氰化合物(Cy3和Cy5)，形成Cy ULS复合体。第二个结合位点将复合物与单链、双链、线性或超螺旋DNA、RNA或染色体的嘌呤连接。