La fragmentación del ADN es un proceso natural que puede observarse en células moribundas y en muestras de ADN antiguas. La fragmentación del ADN es también una técnica importante en biología molecular porque nos permite dividir los fragmentos largos de ADN en tamaños más fáciles de manipular. En la secuenciación de nueva generación, por ejemplo, solo se pueden secuenciar fragmentos de hasta 250 pb. Los fragmentos de ADN habituales son mucho más largos que eso y, por lo tanto, es necesario fragmentar el ADN, o cortarlo en hebras más pequeñas.

Existen varias técnicas de fragmentación del ADN:

Sonicación

En un sonicador, el ADN se fragmenta exponiéndolo a ondas sonoras (normalmente ultrasonidos). Cuando una potente onda sonora golpea la cadena de ADN, crea roturas bicatenarias que cortan la larga cadena de ADN en fragmentos más pequeños. Para obtener un tamaño específico de ADN, es necesario ajustar la potencia y el tiempo.

Enzimática

Las cadenas largas de ADN también se pueden fragmentar usando reacciones enzimáticas. Existen varias enzimas con la capacidad de cortar hebras de ADN y centrarse en sequencias específicas, o cortar el ADN de forma aleatoria.

La fragmentación del ADN es el primer paso de lasecuenciación de nueva generacióny le sigue el paso dereparación de extremos.