有几种方法来阻止电子传递链：

电子传递的抑制剂比如鱼藤酮，抗霉素或氰化物。例如，氰化物离子(CN-)结合细胞色素氧化酶，抑制电子传递链的功能。因此，呼吸链中的氧化还原反应将停止。

解偶联剂或离子载体如2,4-二硝基苯酚(DNP)或羰基氰间氯苯腙(CCCP)。这些化合物是离子载体，这意味着它们在膜中产生孔。在线粒体膜的情况下，这导致质子电化学梯度消散或消失，从而化学渗透不能发生，ATP不能产生。

抑制剂的ATP合酶如寡霉素。