有效的关键发酵是控制和维持在内部的微生物生长和代谢物生产发酵罐或生物反应器。为了实现可持续的微生物生长和代谢产物，必须控制某些参数。这些参数如下：

• 媒体和血管的灭菌
• 媒体中足够的基质和生长因子（例如，维生素）
• 搅拌（搅拌）
• 温度控制
• pH控制
• 抗发泡（在发酵泡沫期间形成，可以破坏测量设备）
• 控制溢出（连续添加介质时使用）
• 通气（有氧过程的氧气供应）

使用发酵非常重要无菌技术。污染物与营养素的生产生物竞争，并导致产品输出减少。