并不是所有的等位基因具有完全外显性，如上例所示。有些等位基因具有不完全外显率，这意味着即使个体具有特定的基因型，这个个体也不会表现出表现型。例如，如果等位基因一个有不完全外显率，大多数人有基因型AA会有深色头发;然而，有些人有完全相同的基因型AA轻的头发。