悠久的历史光学显微镜其宽的应用导致无数样品制备技术。一些标本可以简单登上在显微镜幻灯片上。

通常需要额外的步骤来实现令人满意的结果。大多数这些方法杀死细胞，因此光学显微镜不理想地在活细胞中可视化过程。协议因样品和显微镜而异。以下是组织学准备的一般过程。

准备：

• 固定- 化学固定剂通过防止降解保护组织，并有助于维持细胞和亚细胞组分的结构。光学显微镜最常见的固定剂是10％中性缓冲福尔马林。

• 脱水- 从样品中除去水，因为它不会与嵌入介质混合。

• 嵌入- 将样品嵌入固体外部矩阵中以便于切割。

• 切片- 将样品切成薄片。部分的厚度取决于样本和研究问题。对于常规组织学，这些切片厚度为2-5微米。

• 安装- 将样品连接到显微镜幻灯片。

• 染色- 样品被染色以增加感兴趣的对比度和标签结构。