Nachdem wir nun die dna-probesequenziertHaben,Müsseni线DieN Daten Analysieren Ergebnis。Die Rohbilddaten(Bilder der Fluoreszenzenzansierten Nukleotide)SindSehrGroß;SieKönnenBISZU1TerabyteGroßSein!Die Sequenziermaschine Ist在Der Lage,Einige Daten Zu Verarbeiten,UMDeamigrößezuGrößeZureduzieren。Der Prozess der DateNanalyse Beim下一代测序LässtSich在Drei Schritte Unterteilt Werden:

Primäranalyse.

主要数据分析有3个部分。第1部分显示了Illumina序列标识符,读取序列和PHRED质量分数。第2部分是说明Illumina序列标识符的含义的表格,用于H W U S I E A S 100 R,6,73,941,1973,HashTAG 0,11的标识符的含义。然后6是流动细胞通道。73是流动单元名称中的磁贴数字。941是瓷砖内集群的x坐标。1973是瓷砖内群体的Y坐标。HASHTAG 0是多路复用样本的索引号,0表示无索引。图1是对成对的一对的成员仅读取。第3部分是一个具有列的表,用于验证质量分数,错误的基本呼叫的概率和基本呼叫准确性。 A phred quality score of 10 represents the probability of an incorrect base call as 1 of 10, and a base call accuracy of 90%. As the pred quality score increases, the probability of an incorrect base call decreases, and the base call accuracy increases. At a phred quality score of 50, the probability of an incorrect base call is 1 of 1 hundred thousand, and the base call accuracy is 99.9%.

DiePrimäranalyseUMFASSTLELSCHRITTE,DIEFÜRDENAUFRUF奥德·模具IDIDIFIIIIIERUNG JEDER Base Erforderlich Sind。Neben der Identifizierung der Basen Weist DasSequenziergerätAUCHeineQualitätsbewertärbewEnzelneBase Zu。Das Ergebnis Wird在Der Regel Als Fastq-Datei(Siehe Abbildung)Gespeichert,Die Die Sequenzkennungen,Die Zugeordneten Nukleotide(A,G,T Oter C),Auch“读取”Genannt,und DenZugehörigenPrred-QualitätsScoreHthält。Wenn Ein Nukleotid Zugewiesen Ist N ZugeordNet Ist,Bedeutet Dies,Dass Die Maschine Das Genaue Nukleotid Nicht Bestimmen Kann。Der Phred-QualitätsScoreBeziehtSich Auf Die Wahrscheinlichkeit Eines Falschen Base Aufruf。De Der Regel imSequenziergeätSheadenziergeAutualatischNach Jedem LaufDurchgeführt的De DiePrimäre分析Wird

Sekundäranalyse.

DieSekundäranalyseWird Nach derPrimäranalysedetchgeführt。艾宁·艾哈里士血清·SequenzierenMöchten(Z.B.Von verschiedenen患者患者奥萨斯·奥斯·普莱森Das标签,Auch条码Genannt,IST Eine Kurze DNA-Sequenz,Dem适配器HinzugefügtWird,UM Die Reads der Einzelnen探测祖unterscheiden。Dieses标签Wird Ebenfalls Shequenziert,und Durch Die Identifizierung der SpezifischenAdapersequzzfürjede探测KönnenSIEDIESEVoneinandandandandandenen。死亡的人多路复用Bezeichnet Und Hat DenGroßenVorteil,Dass Die Sequenzierungskosten Gesenkt Werden und Man EineGrößereProbeerhält。Der Este Schritt Vor derDurchführungderSekundäranalyseIstdas Herausschneiden der标签und适配器,Da柴油Sequenzen Keine Biologische Bedeutung Haben。

Sekundäranalyse最重要的是,所有的dna序列都是一样的,该死的,我们将会解释können。如果是Zusammenführung我们会读机器häufig我们会读Qualität如果是我,我们会读它Phred-Qualitätswerten如果是我,我们会读它。我想告诉你我的名字,好吗de novo集会bezeichnet。在我的参考资料中,我的参考资料在我的参考资料中,我的参考资料在我的参考资料中,我的参考资料在我的参考资料中,我的参考资料在我的参考资料中。

正常情况下,我们会读到,在基因组里,我们会读到;死于“Lesetiefe”bezeichnet。当你在迷雾中,你经常会读到更多的东西。Eine Lesetiefe von 10 bedeutet beispielsweise, dass im selben genome bereich 10 Reads übereinander kartiert sind。

Tertiäranalyse.

dietertiäranalyseistwengig,um die sequenzierungsergebnisse zu versehen und zu verwerten。Sie Umfasst Das Varianten呼叫und Eigentliche分析(Z.B.SNP-Profiling,Genomweite Assoziationsstudien,Auffinden von Chromosomenaberrationen und Sonstiges)。

比的变异叫得到它,它是一个探针和一个基准点。我们知道有一个核变异,有一个插入或删除的变异größere有一个结构变异,一个变异和一个变异。

ES Gibt Bestimmte变异,Diefür抗刺逆转录Charakteristisch Sind,Zum Beispiel C> 5'-Ende und G> A AM 3'-Ende。Anhand Dieser MerkmaleKönneniwir静电DNA Indifizieren und von Kontaminierter现代化者DNA Trennen。

Nachdem Wir Die在Der Probe vorhandenen变异identifizier Haben,KönnenWirhenantanysieren unsuchen,Die Biologischen Auswirkungen Dieser变异Zu Versehen,Indem Wirsegen,Indem Wir Zum Beispiel Eine SNP-AnalyzeDurchführen。einem nukleotid kann zu einer unterschiedlichen genexcressionführen,dieeinen bestimmtenphänotyphervorruft;SieKönnenEinigeDieserSnp-Beispiele抗危机格洛兰SNP.NachleSen。

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