我们都知道顺序l'échantillon d' n,我们的德文分析器可以用données代替。Les données brutes (images des nucléotides marqués par荧光)sont très volume: jusqu'à 1 téraoctet !séquençage的机器可以把données变成réduire的机器。分析的过程données du séquençage nouvelle génération peut être divisé étapes:
为了分析primaire

分析主要理解étapes nécessaires的标识符查基。通过对基地的识别,séquençage的机器将qualité的分数归为基地。Le résultat Le plus courant est stocké sous la forme d'un fichier FASTQ (voir image)内容者Le séquence, les nucléotides attribués (A, G, T ou C), également appelés“讲座”,以及qualité博士生“中国雄”。lorsqun nucléotide是attribué à N,机器的隐含可能是déterminer nucléotide精确。分数qualité Phred désigne la probabilité qu'une base soit mal identifiée。在général,我主要分析effectuée自动化在机器的séquençage après查克循环。
L'分析Secondaie.
分析第二题effectuée après分析第一题。当你们从séquencer开始échantillons simultanément(例如,从échantillons开始différents开始),你们就会得到一个名字“中国雄”。这个字幕,également appelé代码栏,是一个séquence d'ADN法院ajoutée à l'adaptateur pour différencier的讲座,从chaque échantillon。这酒的度数是également séquencé,这酒的度数是échantillon,这酒的度数是séparer,这酒的度数是échantillons。méthode, également appeléemultiplexage,一个伟大的优势réduire, coût, séquence和permettre l' obtod 'UN échantillon加上重要。第二个分析的先行效应,première étape包含à éliminer,从生物学意义上来说,它包含séquences个变量和适应变量。
第二分析的主要目标是séquences d'ADN courte (également appelées "lectures")的汇编然后是interpréter la séquence。在réassemblage前面,机器的讲座“野兽”将会在évaluées和filtrées。关于élimine,我们的讲座有qualité不可信的分数,我们的导师résultats。réassemblage是effectué à zéro génome zéro组合新创.洛斯库génome référence是可靠的,过程丰富,再加上简单的汽车就足够了调整器我们的讲座在génome上référence。
标准,plusieurs讲座制图师la même区du génome。这就是所谓的"讲座深奥"讲座的顺序是在différentes讲座的范围内。举个例子,10个讲座隐含的10个讲座叠加在même区génome。
为了分析tertiaire
L'Analyze Tertiaire EstNécessaire倒入Comentre et Donner联合国SensAuxRésultatsduSéquençanage。Elle Compent L'Iditied des Variants et l'分析enquide dite(Par Exemple,Le Profilage des Psn,L'étuded'协会àl'échelledugénome,la recherche d'畸变染色体等)
变量的识别过程包括à déterminer和précision两个变量(或différences)在échantillon和génome之间。这些变化可能是变异的形式nucléotidiques简单,插入或délétions加上小的(appelées索引),或加上大的变异结构catégories告诉我们移位,易位和复制数的变异。
它存在不同的形式spécifiques在caractéristiques样品在d 'ADN旧, par example C > T à l'extrémité 5' et G > A à l'extrémité 3'。À从caractéristiques开始,我们可以区分古代和séparer现代的污染物。
Après avoir identifié les变异présentes在l'échantillon,我们可以用分析器和文章来理解leur影响生物学,例如,有效地分析PSN。différence d'un nucléotide peut entraîner一个表情génique différentielle代替à phénotype spécifique。你们可以举个例子格兰兰的旧PSN.