Esempi di agenti selettivi sono gli antibiotici e i farmaci antimicotici pensati per uso sistemico. Questi composti interagiscono con componenti che si trovano esclusivamente nei microrganismi bersaglio. Se il bersaglio di un farmaco è mutato o non è espresso in un particolare microrganismo, il farmaco non avrà effetto.

La tabella a seguire riassume alcuni esempi di agenti e i rispettivi bersagli: