下一代测序虚拟实验室

在下一代测序(NGS)模拟中，您将获得来自格陵兰岛的一位古人类的头发样本，提取他的DNA，并进行DNA测序。NGS技术使用第二代DNA测序技术，用户可以同时对许多样本进行测序，也被称为大规模并行测序。NGS在现实生活中有很多应用场景。在本实验室中，您将使用SNP(单核苷酸多态性)分析，将结果与物理外观(如头发秃顶、耳垢厚度等)联系起来。通过观察SNP的结果，你将学习如何重建来自格陵兰岛的古人的外貌。

理解从DNA到测序结果的步骤

在下一代测序实验室的第一部分，您将通过样品制备和测序过程的多个步骤，并了解样品的碎片化、末端修复、a -尾蚴和PCR扩增。然后您将进入测序机，在那里您将执行聚类生成，然后进行测序反应和数据收集。这些过程将用3D动画和测验问题来说明。

数据处理与分析

在完成测序过程后，您将获得作为FASTQ文件的数据结果。然后，您的下一个任务是处理它们。通过使用命令行，您将学习如何对数据执行质量控制、消除退化和污染的DNA、裁剪适配器、将序列映射到参考基因组，以及执行SNP分析。通过比较SNP配置文件，您可以研究迁移的模式。你也可以观察特定的单核苷酸多态性，例如，那些导致氨基酸变化并导致特定物理特征的单核苷酸多态性，如头发秃顶或耳垢厚度。请注意，本实验室提供的数据处理和分析可以适用于其他适合不同课程的数据分析工具。

了解所有关于排序的知识

下一代测序实验室强调了样品制备和测序程序，无论不同的下游应用，它们都是恒定的。通过虚拟实验室，您将全面了解获取DNA样本的多阶段过程，并能够使用它来找到测序结果并进行分析。