Molti metodi per laclonazione molecolaresono stati creati per produrreDNA ricombinante. Spesso diversi approcci funzionano per qualsiasi progetto di clonazione. Di seguito sono riportati alcuni metodi consolidati:

• Clonazione con enzimi di restrizione

• Clonazione a ricombinazione Gateway

• Assemblaggio Gibson

• Clonazione Golden Gate