小肠的单层柱状上皮由不同的细胞组成上皮细胞．栅栏状上皮细胞紧密相连细胞连接．肠上皮细胞折叠成手指状突起，称为绒毛．每根肠绒毛都含有血管和淋巴管，这些血管能有效地分配被肠壁细胞吸收的营养物质。这些都是病原体的关键目标，因此肠道内壁是一个重要的屏障，由免疫系统很好地保护。
图1:肠道上皮的组成:(1)绒毛(2)淋巴管，(3)血管，(4)腺体(Lieberkuhn隐窝)，(5)上皮，(6)淋巴细胞，(7)固有层，(8)杯状细胞，(9)微绒毛(10)紧密连接，(11)粘连带，(12)桥粒，(13)间隙连接，(14)神经末梢，(15)毛细血管。