Les alcools rompent lesliaisons hydrogènedans lesstructuressecondaires, tertiaires et quaternaires. Ils forment de nouvelles liaisons hydrogène entre eux et les acides aminés (figure 1). Cela entraine l'exposition des acides aminés hydrophobes à la surface car ils sont plus solubles dans les solvants organiques tels que les alcools, suivi par un changement de conformation de la protéine qui dénature la protéine.

Figure 1 :La rupture d'une liaison hydrogène par l'ajout d'éthanol

C'est ce qui produit par exemple lorsque l'on utilise de l'éthanol à 70 % pour désinfecter la peau avant une injection. L'alcool dénature les protéines des bactéries présentes sur la peau, les neutralisant et évitant une éventuelle infection au site d'injection.