的小肠上皮小肠的上皮经常接触各种微生物和外来物质。它为这些外部挑战提供了物理和免疫屏障。的上皮细胞上皮细胞不断扫描环境寻找抗原能够迅速对病原体做出反应。由于这种持续的暴露，淋巴细胞总是存在于肠道中，每100个上皮细胞中大约有6-40个淋巴细胞。

如果抗原被淋巴细胞检测到，免疫细胞就会发出免疫刺激因子，并初始化信号级联。更多的淋巴细胞被招募并迁移到炎症组织中。上皮结构的彻底改变导致绒毛长度减少，上皮细胞凋亡，隐窝增大。这些变化减少了小肠的表面积，从而导致营养物质的吸收减少。

图1:想了解绒毛淋巴细胞入侵(用蓝色标记)。

小肠炎症可由食源性病原体引起，如沙门氏菌或者买自身免疫性疾病之类的腹腔疾病．