核酸序列可以用几种分子技术分离出来。在分离特定的核酸序列之前，你经常需要提取核酸从其他的细胞。

为了分离出已知的序列，可以使用引物聚合酶链反应或反转录扩增特定的序列

如果感兴趣的DNA序列是质粒的一部分，则是特异性的限制性内切酶可用于隔离。